正直私はどこのチップセットを使っているか、Apple オリジナルかそうでないかについてそう興味がないのですが、なんか論争が起きているみたいなのでコメントだけ。
NEC の PC9821 でもIntel チップセットが採用されていた事から分かる様に、別に Intel ないしはその他のチップセットを使えば即 (狭義での) PC になる、っつーわけではないです。
EFI を採用した時点で現状の PC アーキテクチャからは外れちゃってるし、メモリマップ的にも 640k とそれ以降でRAMを分断するような配置はしてないでしょう。仮想メモリ(てか VMM) のお陰で忘れているけど、(狭義の)PCアーキテクチャである限りあそこの飛び地があるのは変わってないのですよ。
IO的にも Apple 的な機能を備える場面はありえるかと。今でも PS2 やらプリンタのパラレルとかが不要なのでその手のIOがないってのはありますな。もっとも、9821の場合 Cバスという独自バスを死守する必要があったけど、今どきのマックはNuBus も ADB も捨ててますのでそういう面ではお気楽ですけどね。
あ、そか。だから FireWire800 抜きなのかも。